卖家要求扣跑单费不合理，应协商退款。根据《消费者权益保护法》，消费者有权要求合理退款。若卖家坚持扣费，可向消协或物价局投诉。不及时处理可能导致权益受损，影响退款进度和消费者权益保护。
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处理此问题可协商、投诉或起诉。建议先与卖家协商，若协商无果，则向消费者权益保护协会或物价局投诉。若问题严重，可考虑法律途径起诉。
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卖家扣跑单费不合理。操作如下：1. 与卖家协商，要求合理退款；2. 协商无果，保留证据，如发票、收据，向消协或物价局投诉；3. 若投诉无果，且损失较大，可咨询律师，考虑起诉维护权益。