乡镇卫生院科室外包违法。依据《医疗机构管理条例》，科室外包属非法行为，可能导致医疗质量下降、患者权益受损。若不及时纠正，可能面临法律制裁及声誉损失。
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乡镇卫生院科室外包需禁止，常见处理为加强监管与自查。选择处理方式时，应依据法规严格审查，确保医疗活动合法合规，避免法律风险。
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科室外包不可行。具体操作：1.立即停止外包行为，恢复自主运营；2.开展内部自查，确保所有科室符合医疗规范；3.加强医护人员培训，提升服务质量；4.如已签订外包合同，应尽快协商解除，并处理善后事宜。